Asi es, a la página inicial debes llamarla index.html y a todas las otras como quieras , por ejemplo especies.html
Y vete leyendo
esto, para que a medida que vayas trabajando en la página, la vayas limpiando (el codigo digo) y puedas sacarle mayor provecho. Por supuesto empieza por los que dicen introduccion, sobre todo el html y css.
Un saludo