Arreglo Bidimencional en C#

[Peterpay]

pero si te das cuenta es una aplicacion windows y no web.

lo mejor que puedes hacer para este tipo de problemas es que tus controles tengan la misma distribucion que deseas, es decir si tienes una matriz de Textboxes puedes usar un container como el tablelayoutpanel meter tus controles y simplemente hacer algo como

for(int filas=0; filas<controlTableLayout.RowsCount;filas++)
for(int columnas=0;columnas<controlTableLayout.ColumnCount ;columnas++)
matriz[fila,columnas]= int.Parse(((TextBox)controltableLayout.GetControlF romPosition(filas,columnas)).Text);

PD puede haber errores de sintaxis pero creo que seria la mejor solucion para tu problema.