No borra el directorio.

[Fuzzylog]

También puede ser que el path que le estás pasando con destino no lo esté recogiendo bien, o tenga un formato que no sepa interpretar.

Usa esto para controlar que es lo que está haciendo o dejando de hacer

import java.io.*;

public class BorrarDirectorio
{
public static void main( String [] args ) throws IOException
{
File f = new File("c:/myDirectorio");

if(f.exists()){
if(f.delete())
System.out.println("Borrado con exito :)");
else
System.out.println("Se ocaciono un error al borrar el directorio :(");
}else{
System.out.println("El directorio no existe :(");
}
}
}