Replace() reemplaza todo la cadena!!

[Peterpay]

yo haria algo como

char []separador=new char {' '};

string []datos=filter.Text.Split(separador);

string cadenaAntesDelSegundoEspacio=datos[0]+" "+datos[1];
string cadenaDespuesDelSegundoEspacio="<br />"+string.Join(" ", datos, 2, datos.Lenght -2);

string final=cadenaAntesDelSegundoEspacio+cadenaDespuesDe lSegundoEspacio;

claro esto no es lo mas elegante posible pero funciona y ojo, que debes agregar validaciones para el caso en que el texto no tenga mas de 1 espacio.