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Iniciado por GatorV 
El problema como ya te comentaron no es PHP como tal, PHP se ejecuta bajo el usuario que tu hayas configurado, y si ese comando solo funciona sobre root, necesitas o a) cambiar PHP para que se ejecute sobre root (mala idea) o b) usar una herramienta como sudo y agregar al usuario bajo el que esta PHP al archivo sudoers para que pueda usar ese servicio.
Saludos.
ya se que php no tiene la culpa, yo pienso que tengo que darle permisos a la herramienta rndc pero no tengo ni idea de cual sera su usuario pero tambien e configurado el archivo con permisos 777