Hola Chuty:
kao (nuestro moderador) tiene un tema con las FAQs de este foro, y Carlitos (otro buen amigo) preparó un índice para la búsqueda en las Faqs (los 2 primeros temas del foro).
Seguro que ahí hay información sobre esas ventanas aunque te trataré de resumir la respuesta:
window.open es una función con 3 parámetros. El primero es el nombre de la página, el segundo el nombre de la ventana (atributo target) y el tercero es la cadena de las especificaciones separadas por comas:
Si quieres abrir una ventana de 300 x 200 con la página ventana.php, la cosa sería algo parecido a esto:
window.open("ventana.php", "", "width=300,height=200");
Hace poco respondí algo parecido y está en
esta discusión .
Saludos