para ese tipo de comparacion tienes que utilizar el operador logico de igualdad. tienes que tomar referencia de los campos a compararse, mas o menos como el compañero anterior te mostro. luego, basicamente tienes que escribir un condicional para tomar la decision si escribir F o V en el tercer campo. aqui una lista de los diferentes
operadores logicos.
Código:
var campo1 = document.getElementById("id_campo1").value;
var campo2 = document.getElementById("id_campo2").value;
document.getElementById("id_campo3").value = (campo1 == campo2)? "V": "F"; // condicional ternario, lo mismo que un if/else;