tengo la tabla vacia y me dice que tengo registros

[spider_boy]

A ver... analicemos tu código

Código php:

$consulta_numep="SELECT * FROM estados_pago Where num_ep=".$ep_num;  
$resultado=mysql_query($consulta_numep) or die (mysql_error());  
if (mysql_num_rows($resultado) == 0)  
{  
echo "<script>history.back(alert(\"El numero de Estado de Pago ya se ha ingresado.\"));</script>";
}
 

Como puedes ver, tu preguntas si la cantidad de registros es igual a 0, osea que no existen, y si esa condición se cumple ejecutas el echo. En otras palabras, si tu tabla está vacía ejecutas el echo. En vez de poner "== 0", deberías poner " != 0".

Nos vemos.