Si, la veo. Mismo en los margenes superior e inferior, que se anulan.
Ahora ya no puede acceder a tu pagina para chequear el codigo fuente, pero no veo por que jquery pueda estar interfiriendo con la css.
Estas usando .show() y .hide() ? Probastes otros efectos? Desde show("slow") a FadeIn() , etc. A ver si encontras una alternativa. Mismo la propia UI tiene efectos muy buenos, como Fold.
http://docs.jquery.com/UI/Effects/