Mi opinion personal es que no, no se debe usar el atributo $uses excepto en el caso que comenté, y aun así casi siempre puedes usar componentes en vez de eso, que aportan mayor semántica (vamos, que es mas facil de entender un programa que tiene por ejemplo un componente que se llame 'autentificación', que simplemente otro que simplemente dice que appController 'uses' el modelo 'Usuario'). Asi que en resumidas cuentas: yo personalmente jamás uso $uses y muchos desarrolladores cake
tampoco.
Si es tu primer framework no te preocupes, que la curva de aprendizaje puede ser un poco "empinada" pero te aseguro que la productividad será ordenes de magnitud mayores una vez lo controles. Ánimo!!!