Redirecciona cuando cambies los nombres de las páginas. Lo que le pasa al sitio no es sandbox es que has mareado al robot, ahora aparece un sitio, ahora no están las páginas, ahora aparecen en otro lado... (pensamiento de google)
Bah yo no indexo nada hasta que se aclare. 
Sobre las preguntas:
Las 3 se pueden responder igual DEPENDE.
Casi todos los enlaces valen sólo descarta los de sitios sin nigún interés. Si haces dos webs de la misma temática alojadas en el mismo hosting valen menos pero no creo que Google se limite a basarse en la dirección de la ip, seguro que si pones Adsense en las 2 webs Google también las relacciona... es por esto por lo que en el foro lees habitualmente la frase "piensa en el usuario no en el buscador". Vas a dedicarle mucho tiempo y dinero a hacer algo para el buscador. Haz una web buena, lo mejor que puedas. Dividela sólo si es necesario para los usuarios, en caso contrario no lo hagas.
Si quieres aprovechar el otro dominio crea un sitio en ese mismo hosting, no es una gran ayuda pero ahorrarás tiempo y dinero.
