hola Gaug
yo te recomiendo hacerlo con una matriz de mxn donde m sean tus parciales y n el numero de alumnos por ejemplo asi
Código:
// aqui lo declaras
double [][]matriz=new double[3][10];
//aqui lo recorres
for(int i=0;i<matriz.length;i++)
for(int j=0;j<matriz[i].length;j++)
matriz[i][j]=valor //aqui asignas los valores a la matriz
ojala y te sirva, saludos