Te sugiero usar una matematica sencilla con el operador de porciento (%).  Así podras buscar los impares y pares y publicar lo que quieres con ese impar.  Por ejemplo dentro de un for puedes hacer esto 
 
Vamos a suponer que el archivo se llama links.txt.    
Código PHP:
Ver original- $getTxt = file("links.txt"); 
- for($i=0; $i<count($getTxt); $i++){ 
-   if(($i%2)!=0){ 
-     echo "<a href='".$getTxt[$i]."'>".$getTxt[$i]."</a><br />\n"; 
-   } 
- } 
Con eso vas a obtener todos los links.  Haz la prueba y nos dejas saber. Si no sabes para que se usa el % visita el 
wiki del foro que alli te explican como usarlo