el linked server lo tendrias que configurar en tu server fuente (donde ejecutaras tu proceso) para apuntar hacia el server destino.
Configuring Linked Servers
despues podrias acceder a la tabla haciendo referencia con el nombre en 4 partes..
[Server].[base de datos].[owner].[nombre tabla]
por ejemplo
Código:
SELECT MISCAMPOS
FROM MISERVIDORLINKED.MIBD.DBO.MITABLA
WHERE MISCONDICIONES

Saludos!