El problema estaba que cuando ejecutas el build.xml te crea el mappin incompleto ya que a la hora de crear la clase pone esto:
Código:
<class name="Persona" table="persona" catalog="prueba">
en vez de poner esto:
Código:
<class name="com.persona.Persona" table="persona" catalog="prueba">
ese era el error, muchas gracias de todas formas.