Puedes usar el Nero. Creas un "CD de audio" y al grabarlo él ya se encarga de convertirlo a CDA... Es decir en el Nero metes tus MP3, WAV, etc..., y cuando le des a grabar el Nero hace la conversión necesaria automáticamente. Supongo que habrá más programas que lo hagan pero el Nero lo suele tener todo el mundo... Tienes la limitación de 80 minutos de audio por CD, pero es que los CD de audio son así, o sea que no vas a poder meter más aunque quieras...
Respecto de lo segundo, depende del lector, tendrías que averiguar si el lector soporta los R o RW. Normalmente con los R no hay problemas, pero los RW se atragantan a veces...