Todos los contenidos y configuraciones de Joomla las manejas desde un panel de administración, el cual generalmente se ubica en la sección tusitio.com/administrator.
Y este panel modifica todos los códigos del sitio según lo que configures en dicho lugar.
Esto va ligado con una plantilla que tiene también una o más hojas de estilos CSS. La plantilla funciona con posiciones que puedes utilizar desde el panel.
Creo haberme explicado.
Suerte!
Saludos a Larenz!