Asumo que estas usando Windows y python 3.0
Código:
side= int(input("¿Cual es el lado del cuadrado"))
Prueba con este codigo
Código:
side= int(input("Cual es el lado del cuadrado?\n"))
Si bien por python 3.0 maneja todos los archivos por defecto con utf-8 y estas usando un encoding diferente.