... creo que necesitas el paquete para desarrollo (estás compilando). Debería ser
libxml2-dev
Prueba. Suerte
Edit: ... sugerencia no pedida :-/: Quizá querrás utilizar el parámeto
–prefix=/ruta/ para evitar posibles problemas si quisieras eliminar tu compilación. Igual quizá querrás utilizar
checkinstall para crear un .deb y poder instalar/desintalar como cualquier otro paquete (desde synaptics en tu caso ... o como se llame
).
Nuevamente, suerte