Para lograr lo que indicas, es necesario empaquetar tu aplicación en un archivo JAR, que podría ser ejecutado en cualquier máquina con la JVM instalada.
Por lo general las IDE's brindan facilidades para esto. No uso mucho Eclipse, pero quizás este link te pueda orientar:
http://wiki.eclipse.org/FAQ_How_do_I...SWT_program%3F
Espero sea de ayuda,