Hola:
No sé si has solucionado tu problema pero yo no lo veo fuera de sitio. Lo que si he visto (en Firefox) es que el logotipo ocupa más del alto de la cabecera lo que hace que se descoloque el menú y por descontado el cuerpo.
La solución es que en el height del id cabecera cambies su valor de 85px por 109px.
Saludos.
