Cuando hagas el query creas una condicion y verificas si es mayor a la fecha actual. Algo así
Código PHP:
Ver original//despues del query y entendiendo que las fechas las tienes declarada YYYY-MM-DD
$fecha_base_de_datos = strtotime($row["Fecha"]); if($fecha_base_de_datos < mktime()){ echo "<font color='#ff0000'>".$fecha_base_de_datos."</font>";
}