Hola, mooguel.
Pues si que se puede:
<div style="position:absolute;width:120;height:100;scro llbar-base-color:#ff0000;overflow:scroll">Capa</div>
Te he puesto un ejemplo sencillo pero puedes utilizar todas las opciones para scroll (scrollbar-face-color, scrollbar-shadow-color, etc.)
Espero que te sirva. Saludos,