¿Y no puedes poner el enlace en el propio swf? De todos modos la etiqueta embed no es válida, te aconsejo que uses <object> de cualquiera de las
diferentes formas que hay de hacerlo más accesible.
También puedes poner el enlace después del flash, declararlo como bloque con las mismas medidas que el swf y colocarlo absolutamente encima de él.
Avisa con lo que decidas por si necesitas más ayuda.
Salud!