Si son necesarios recuerda que una cosa es PHP que se ejecuta en el servidor, otra cosa totalmente independiente es HTML. PHP lo único que hace es procesar el script e imprimir el HTML correcto.
Ya en HTML sí necesitas los tags para importar el CSS y lo demás pero necesitas la ruta correcta y la forma más sencilla es usando paths absolutos:
Código html:
Ver original<script src="/scripts/script1.js" type="text/javascript"> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/style.css" />
(nota el uso de "/" al inicio, esto denota que va a buscar desde root.
Saludos.