Problemas al subir BD al Servidor - Ayuda Por favor

[astcv]

Hola, necsitaria que me echarais una mano aunque sea al cuello, llevo varios días buscando soluciones para lo siguiente y no consigo averiguar como puedo hacerlo, os explico:

He desarrollado un página Web con dreamweaver y php, utilizando para las Bd MySql y Phpmyadmin, funciona todo correctamente, pero ... claro cuando he necsitado subirme al servidor las Bd de prueba he efectuado las importaciones desde un archivo .txt de forma manual con phpmyadmin y ningun problema, ahora necesito desarrollar un script que me permita subir las actualizaciones de estas Bd de forma automatica por la noche y la verdad no tengo ni idea de como lo tengo que hacer, no spy capaz de verlo. Os agradecería mucho vuestra ayuda.