Problemas con PHP OO, Ajax y frameworks

[chucky2183]

Hola. Tengo el siguiente problema. Tengo una clase UI.php que divide la web en secciones es decir el panel izquierdo, el derecho, el encabezado y el pie. Bueno yo uso todo ajax es decir todo lo cargo en el mismo div. Pero mi problema es que quiero usar una libreria jquery para hacer efectos y el php que tengo(Funciones.php) tiene varios metodos que me devuelven ciertas partes de la web como ser Principal, informaciones, contactos, etc(funciones que me devuelven con ajax). Ahora como puedo hacer para usar porque ese php me devuelve solo el codigo que voy a insertar con ajax pero si le pongo metodos javascript no funciona. Alguien sabe como puedo hacerlo?

Gracias