Hola.
1) es cierto lo que dicen de los archivos .exe, necesitas el wine
2) los archivos php los puedes editar con cualquier editor de textos nano, vi (desde consola) o el gedit, emacs (modo grafico), me parese que ubuntu no viene con php ni apache, asi que los tendras que instalar y la carpeta publica de apache se encuentra en /var/www
3) los archivos zip no deberia de tener problemas para leerlos, en cambio los rar si pero existe una pequena version para manejar esos archivos, lo malo es que se maneja desde consola (malo para ti).
4 y 5) el amsn es bueno y si dices que no te funciono es por que no tienes todas las dependencias
6) para el manejo de paquetes a mi me gusta usar la terminal (consola).
apt-get install <paquete> para instalar
apt-cache search <paquete> para buscar
antes de poder buscar e instalar es necesario actualizar los repositorios
apr-cache update
suerte y cualquier cosa en la que podamos ayudar aqui estamos y bienvenido a la comunidad linux espero y llegues para quedarte
ahh se me olvidaba google tiene una seccion especial para linux
google.com/linux
y recuerda siempre. RTFM