Hola
No entiendo porque dices que no se puede hacer un trust con otro dominio??
tu puedes instalar junto con SBS otros servers miembros, servers Unix, controladores de dominio.
lo unico que no se puede es tener otro SBS y ademas el SBS debe ser instalado como root en active directory dentro de una forest.
te dejo un link
aqui
p.s. solo tengo la duda si tus dominios son separados o son padre e hijo?