Hola
prueba con algo como esto y ya lo adaptas a tus necesidades:
Código HTML:
<html>
<body>
<script>
function sel_all(){
for(i=1; i<9; i++){
document.getElementById('checkbox'+i).checked=true;
}
}
</script>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox11" id="checkbox1">q
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox81" id="checkbox2">w
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox71" id="checkbox3">e
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox61" id="checkbox4">r
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox51" id="checkbox5">t
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox41" id="checkbox6">y
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox31" id="checkbox7">u
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox1" id="checkbox8">i
</div>
</label></td>
<td><label>
<div align="center">
<input type="checkbox" name="checkbox1" id="check1" onclick='sel_all()'>seleccionar todos
</div>
</label></td>
</body>
</html> suerte.