Hola:
Es algo así...
Lo que dices es lo que tienes que poner en el fichero js (en el ejemplo que te envié antes era ficheros.js, pero en tu caso podría ser menu.js)
...y en la página html dejar la etiqueta script, pero ponerle también el atributo src con la ubicación del fichero (si va en el mismo directorio, algo así: src="menu.js"
Trata de probar, y si te falla algo, pon ¿cómo lo has hecho para poder ver como arreglarlo.
Saludos