Gracias, investigue sobre eso y con este codigo consegui ejecutar un asp desde una aplicacion C# sin necesidad de abrir el internet explorer:
string address = "midireccionweb/pagina.asp";
WebClient httpRequest = new WebClient();
StreamReader rdr = new StreamReader(httpRequest.OpenRead(address),
System.Text.Encoding.ASCII);
string streamText = rdr.ReadToEnd();
rdr.Close();
