Hola:
Mira este enlace de
JComboBox con base de datos. En concreto, al apartado añadir más en los items del JComboBox.
La idea básica es en vez de añadir al JComboBox un String y fiarte de su posición, se le añade un objeto que tenga el metodo toString() y guardado dentro el valor que quieras.
Se bueno.