Cita: Hay alguna forma de llamar a un documento sin que el codigo aparesca en el codigo fuente??
Si, llamarlo mediante Ajax. Lo que pasará es que se modificará el DOM, pero hasta hoy (creo que) los navegadores no muestran esos cambios en el código fuente. Claro que se puede ver el código fuente generado mediante extensiones como web developer tootls de FF. Pero por lo menos reduce el número de personas que ve el código. Sin embargo, no lo recomiendo ya que es susceptible a fallar y poco amigable para los navegadores además de que puede afectar tu accesibilidad.
Todo archivo que contenga el más mínimo bloque de php necesita extensión php para que el servidor lo identifique.
Saludos.