Acceder a los elementos de una ventana secundaria

[Jeibi]

Bueno, ya lo solucione.
Por si a alguien le sirve de ayuda.
El problema estaba en que no funcionaba porque todavía no existia el elemento. Al poner el javascript en el head, lo ejecutaba primero antes de poner el html.
Y lo solucione poniendo el javascript que tenia de forma global, menos la declaracion de las variables que quería tenerlas en global, y lo puse en una función. Y entonces llamo a la función desde el 'onload' del body.