una ayudita simple por favor

[golem44]

No me es familiar el codigo que describes pero creo que lo lógico seria darle la orden de cerrar la ventana que esta abierta primero y despues el script que ya tienes.
Podría ser esto?:
function MM_closeBrWindow(theURL,winName,features) { //v2.0
window.close(theURL,winName,features);