Hola:
Puedes crear una hoja de estilos media print, más o menos así:
<style type="text/css" media="print" >
* {display: none;}
.imprimible {display: block;}
</style>
Y luego, si quieres imprimir la capa "seccion1", pones algo así:
document.getElementById("seccion1").className = "imprimible";
print();
document.getElementById("seccion1").className = "";
Tal vez convenga temporizar la última línea... pero mejor pruébalo antes.
Saludos