Hay un tema de hace poco que habla de esto. Justo con tu placa de video hubo problemas con sierta actualización de Ubuntu, y desde el link que pasaste, abajo esta el update que envía a este tema:
http://webupd8.blogspot.com/2009/05/...iver-news.html que dice que con actualizar el sistema operativo se soluciona.
¿Tenés todo actualizado?
¿Vas a usar Compiz?
Saludos