Creo que es sólo cuestion de suerte, cambia el mainboard y deja tu disco duro igual; windows 98 en adelante reconocerá el nuevo hardware e instalará ó solicitará los nuevos drivers (la suerte radica en si lo hará bien o mal
).
El problema de pasar windows sin reinstalar desde cero es que se quedará también con los drivers del mainboard anterior sin usarlos ó causando errores (los que causen errores debes deshabilitarlos) tanto driver inutil hará ocupar mucho espacio y hara mas lento tu sistema.
