... ¿y qué tienes en mente?.
Con un Cron podrás ejecutar un script PHP en tu servidor, la pregunta es, ¿cómo, con ese script, comprobarás si el usuario está activo?
...
Fuera de lo que tengas en mente --que sería bueno explicaras-- creo, para tu propósito, necesitas más de JavaScript que de alguna tarea programada. Con JS puedes enviar una petición al servidor cada cierto tiempo para indicar está navegando por tu sitio, puedes llegar hasta el punto de detectar cuándo en verdad fue que estuvo activo (presionó alguna tecla o movió el ratón).
Con un Cron no veo cómo puedas llegar a algo así ... quizá contar las sesiones abiertas, pero podría no ser un indicativo tan fiable.
Nada más ahí como información. Un saludo
