tenes que hacer algo asi mira:
Código PHP:
<?php
/* Preparas el recurso que vas enviar */
$StPr = mssql_init("procedure" , $conection );
/* aca bindeas las variables al recurso */
mssql_bind($StPr, "@id", $id, SQLINT4, FALSE);
mssql_bind($StPr, "@name", $name, SQLVARCHAR, FALSE);
/* ejecutas el procedure */
$result = mssql_execute($StPr);
?>