Pues tal cual lo indica en el Manual es para poder iniciar partes especificas, por ejemplo si quieres usar rutas personalizadas:
Código php:
Ver originalprotected function _initRoutes() {
$this->bootstrap('frontController');
$front = $this->getResource('frontController');
$router = $front->getRouter();
$route = new Zend_Router_Route_Static(/*blah*/);
$router->addRoute($route);
}
Saludos.