No sabes como te agradezco la ayuda... Añadiendo ese query ahora me llega la Ñ correctamente desde el input en la web hasta el MySQL

Voy a mirar que hace ese query.. no tenia ni idea que existiera...
Ahora el único problema que tengo es el listado, que me sale el signo � en lugar de la Ñ. ¿Alguna sugerencia?
Respondiendo a tu pregunta, muestro el resultado en un documento Html, en donde tengo puesto el meta:
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />
Sin embargo hay un javascript por el medio que hace la llamada AJAX, no se si ahi puede estar el problema.
Muchas gracias.