trata colocando esta instruccion ob_end_clean() antes de empezar tu pdf, algo asi:
Código PHP:
ob_end_clean();
require('include/fpdf.php');
$pdf=new FPDF();
$pdf->AddPage();
$pdf->SetFont('Arial','B',16);
$pdf->Cell(40,10,'¡Hola, Mundo!');
$pdf->Output();