No estás usando css, por lo que este foro no sería el lugar más adecuado (quizás el de (x)html o web general ¿?)
Tienes un planteamiento que creo erróneo:
Tienes todos los campos repartidos en dos columnas y en cada una de ellas alojas TODOS SUS elementos en un <p>....</p>, mezclando textos, imputs, selects, etc, separando en la vertical con <br />
Y como no es igual la altura de línea de los campo que de los saltos de línea que de ... se produce ese desajuste.
Un saludo