DragonX no termino de entender lo que has hecho. En un hosting windows no puedes usar el .htaccess, el lenguaje php (incluidas las redirecciones) sí.
Tienes un lío grande porque "oficialmente" (a los ojos de Google) tienes la web duplicada.
http://www.google.com.ar/search?hl=e...G=Buscar&meta=