Yo creo que depende de a quién esté dirigida la web. En mi caso las visitas se distribuyen al 50% entre las dos resoluciones, lo cual tiene su justificación: al ser una web de películas divx la gente que la visita tiene ordenadores nuevos y pueden tener la 1024x768 para ver la película más grande (aunque se vea igual que 800x600, pero les hace ilusión), por lo que la proporción aumenta hasta igualarse a la 800x600. Además tengo visitas con más resolución (1152x864 y 1280x1024)
En mi ordenador uso 800x600