Hola:
Prueba a ponerlo así:
Código:
margin-bottom: x !important;
margin-bottom: y;
siendo x el valor del margin-bottom que necesites en firefox e y el valor que necesites en IE.
Esto hará que FF le de prioridad a ese margin-bottom (el marcado con !important), IE no reconoce el important con lo que el valor del segundo margin-bottom anulará el primero.
Saludos.