Te comento que un amigo lo hizo para el egreso e ingreso de personal de una empresa, y lo desarrollo todo en Delphi.
Me dijo que hay que buscar librerias que tengan que ver con huellas dactilares, porque si te pones a hacer un algoritmo que compare cada una de ellas no terminas mas. Hay muchas librerias libres, buscalas en google o en algun lado tienen que estar.
Aca hay un tema en otro foro sobre lo mismo:
Huellas digitales
Y aca una libreria que trabaja con imagenes:
Huellas JPG etc
Saludos!
PD: Delphi combinado con Visual para darle una apariencia amigable