como estrucutar mi sitio cuando utilizo include()

[LeandroA]

buenas, tengo una duda (novato) como deberia estructurar mi sitio ya que estoy utilizando include() de otras paginas php que estan dentro de unas subcarpetas. la pregunta es que en donde deberia poner las imagenes o link de descarga porque al incluirla en index.php cambian las rutas entonses los links de las imagenes quedan rotos

se que si bien podria poner los link justo sobre la raiz, esto funcionaria pero se me complica para poder diseñar cada pagina ya que estaria agregando las imagenes pero no las prodira visualizar hasta que ejecute el index.php que llamara con include() a estas pagina.

bien no se si me explico, como se hace esto frecuentemente o la forma correcta de trabajar esto.